本市養殖面積3,454公頃(34.54平方公里)佔高雄市總面積1.32%。依據111年漁業統計年報，養殖漁業產量2萬9,272公噸、產值39億3,693萬元，其產量大宗之前三項養殖魚種為虱目魚、石斑及鱸魚，而產值大宗之前三項養殖魚種為虱目魚、石斑及白蝦。各養殖魚種主要產地，石斑魚為永安及彌陀；虱目魚為茄萣、永安、路竹及湖內；白蝦為路竹及湖內；鱸魚為彌陀、永安及路竹；吳郭魚為湖內、及彌陀。
為加強本市養殖生產環境及發展需要，提高水產品品質衛生及產業秩序化發展，本市劃設5處養殖漁業生產區，包括興港養殖漁業生產區面積440公頃、彌陀養殖漁業生產區面積271公頃，永安養殖漁業生產區面積414公頃、永華養殖漁業生產區面積376公頃及新港養殖漁業生產區面積301公頃；及1處彌陀養殖魚塭集中區面積59公頃，合計1,861公頃。
為能改善本市養殖漁業進排水設施，確保養殖產業發展，本局陸續辦理養殖漁業生產區魚塭土溝及土堤道路改善工程、養殖區排水路清淤工作。另台灣中油從國外進口液化天然氣（LNG），為讓超低溫輸送之LNG升溫汽化，需透過大量海水進行熱交換，隨後海水溫度降低後排出，稱為「冷排水」，海水使用前經過三道潔淨過濾處理，水質純淨，且終年溫度維持在22-24度稱為「鑽石水」，特別適合魚類養殖，這些珍貴的冷排水若直接流入大海，十分浪費，海洋局與農業部漁業署累計投入1至7期工程建置冷排水良善供水系統，目前累積建置長度約5,157.5M，提供永安區養殖漁業生產區漁民取用做為養殖水使用，受益面積達500公頃，成效廣獲好評，海洋局持續辦理第8期延伸工程可行性評估，做為未來供水系統延伸建置之參考，擴大嘉惠養殖魚塭面積。